MARC

 008240306s2023        us            s          000c|  eng  d
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■020    ▼a9798380312431
■035    ▼a(MiAaPQ)AAI30524435
■040    ▼aMiAaPQ▼cMiAaPQ
■08204▼a574▼222
■090    ▼a전자도서(박사논문)
■1001  ▼aMantri,  Madhav.▼0(orcid)0000-0001-9844-7852
■24510▼aSpatiotemporal  Profiling  of  Gene  Expression  in  Health  and  Disease▼h[electronic  resource]▼cMadhav  Mantri
■260    ▼a[S.l.]▼bCornell  University.  ▼c2023
■260  1▼aAnn  Arbor▼bProQuest  Dissertations  &  Theses▼c2023
■300    ▼a1  online  resource(p.275  )
■500    ▼aSource:  Dissertations  Abstracts  International,  Volume:  85-03,  Section:  B.
■500    ▼aAdvisor:  De  Vlaminck,  Iwijn.
■5021  ▼aThesis  (Ph.D.)--Cornell  University,  2023.
■506    ▼aThis  item  must  not  be  sold  to  any  third  party  vendors.
■520    ▼aAdvances  in  single-cell  RNA  sequencing  and  spatial  transcriptomics  have  transformed  our  understanding  of  cell  biology,  allowing  for  the  study  of  gene  expression  at  the  single-cell  level  within  the  context  of  tissue  architecture.  Here,  I  leverage  the  power  of  these  technologies  to  investigate  three  critical  biological  processes:  cardiac  development,  viral  myocarditis,  and  ovulation.  First,  we  combine  spatiotemporal  transcriptomics  with  data  integration  algorithms  to  study  the  development  of  the  chicken  heart.  By  spatial  mapping  of  cellular  differentiation  trajectories,  we  reveal  transcriptional  differences  between  epithelial  and  mesenchymal  cells  in  the  epicardial  lineage  to  uncover  an  intricate  interplay  between  cellular  differentiation  and  morphogenesis.  Using  spatially  resolved  expression  analysis,  we  report  anatomically  restricted  expression  of  extracellular  matrix-associated  genes  and  genes  implicated  in  congenital  heart  disease.  Shifting  our  focus  to  viral  myocarditis,  a  leading  cause  of  sudden  death  in  children  and  young  adults,  we  investigate  the  temporal,  spatial,  and  cellular  heterogeneity  of  host-virus  interactions  and  spatially  confined  cell-cell  interactions  linked  to  reovirus  infection  in  neonatal  mice.  We  report  cytotoxic  T  cell-mediated  pyroptotic  cell  death  of  infected  endothelial  cells  in  the  myocarditic  heart,  thus  elucidating  the  pathogenesis  of  reovirus-induced  myocarditis.  To  broaden  our  perspective  and  explore  new  frontiers,  we  then  employ  single-cell  transcriptomics  to explore  the  poorly  understood  genesis  of  villus  smooth  muscle  cells  in  the  intestine.  We  identify  a  local  hierarchy  of  subepithelial  fibroblast  progenitors,  including  an  intermediate  myofibroblast-like  cell  phenotype,  that  progress  to  form  and  renew  mature  smooth  muscle  fibers  throughout  life,  thus  paving  the  way  for  new  strategies  to  accelerate  recovery  of  digestive  function.  Lastly,  we  investigate  the  effects  of  blocking  calcium-release  activated  calcium  channels  with  BTP2  in  human  peripheral  blood  mononuclear  cells  stimulated  with  the  mitogen  phytohemagglutinin  (PHA).  By  examining  immunoregulatory  genes,  we  observe  a  shift  towards  immune  tolerance  and  suggest  a  potential  therapeutic  value  of  BTP2  in  autoimmune  diseases  and  organ  transplantation.  Collectively,  my  work  highlights  the  immense  potential  of  single-cell  and  spatial  transcriptomics  in  unraveling  intricate  biological  processes  in  both  health  and  disease  contexts.
■590    ▼aSchool  code:  0058.
■650  4▼aBioinformatics.
■650  4▼aCellular  biology.
■650  4▼aMolecular  biology.
■650  4▼aGenetics.
■653    ▼aGene  expression
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■653    ▼aMuscle  cells
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■653    ▼aRNA  sequencing
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■690    ▼a0379
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■71020▼aCornell  University▼bComputational  Biology.
■7730  ▼tDissertations  Abstracts  International▼g85-03B.
■773    ▼tDissertation  Abstract  International
■790    ▼a0058
■791    ▼aPh.D.
■792    ▼a2023
■793    ▼aEnglish
■85640▼uhttp://www.riss.kr/pdu/ddodLink.do?id=T16933067▼nKERIS▼z이  자료의  원문은  한국교육학술정보원에서  제공합니다.
■980    ▼a202402▼f2024

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